A PUC-Campinas, por meio da Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação, desde 2010, vêm oferecendo aos alunos do Colégio de Aplicação PIO XII a oportunidade de participarem do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica, atividade com a chancela do CNPq, que promove a participação de nossos alunos do Ensino Médio em atividades de pesquisa científica ou tecnológica, orientadas e supervisionadas por docente pesquisador da PUC-Campinas. Nesses anos, a PUC-Campinas concedeu 132 Bolsas IC-EM aos alunos do Colégio PIO XII.